В 1972 г. окончил физический факультет Тбилисского государственного университета. После окончания университета В.Б. Заалишвили начал работать в Институте строительной механики и сейсмостойкости АН ГССР, а в 1982-1990 г. - в лаборатории сейсмического микрорайонирования.

В 1986 г. в Институте геофизики АН Грузии защитил кандидатскую диссертацию "Сейсмическое микрорайонирование по данным искуственного возбуждения колебаний грунтовой толщи", а в 1996 г. под руководством член-корр. РАН А.В. Николаева подготовил и защитил на физическом факультете МГУ им. М.В. Ломоносова докторскую диссертацию на тему "Сейсмическое микрорайонирование на основе изучения нелинейных свойств грунтов". В 2005 г. защитил докторскую диссертацию в Институте геофизики АН Грузии. В 2007 г. получил звание профессора. 

В 1997 г. организовал в Грузии и был до 2005 г. директором Центра прикладной геофизики, инженерной сейсмологии и сейсмической защиты сооружений (AGESAS). В 2000 г. организовал Северо-Кавказское отделение Института Физики Земли им. О.Ю. Шмидта РАН, директором которого являлся до 2007 г. В 2002 г. организовал Национальный комитет Грузии по сейсмостойкому строительству и инженерной сейсмологии и при поддержке российских коллег ввел его в Европейскую ассоциацию. Был его первым вице-президентом в 2002-2008 гг.

С 2003 г. работает директором Федерального государственного бюджетного учреждения науки Центр геофизических исследований ВНЦ РАН и РСО-А.

Заалишвили В.Б. создал новое научное направление в виде оценки сейсмической опасности территории на основе учета нелинейных свойств горных пород мощными невзрывными источниками, им впервые введены показатели движения в виде площадей нормализованного и реального спектров колебаний, он предложил новый инструментально-расчетный метод сейсмического микрорайонирования, создал и развивает научную школу в области инженерной сейсмологии России.

В 2004 г. на основе анализа инструментальных данных обосновал основные этапы процесса схода ледника Колка 20 сентября 2002 г. в РСО-А. В 2005 г. разработал новый расчетно-инструментальный метод сейсмического микрорайонирования.

В 2013 г. Заалишвили В.Б. руководил созданием первых в России вероятностных карт СМР гг. Владикавказ, Беслан, Ардон, Алагир, которые являются непосредственной основой сейсмостойкого проектирования и строительства.

Заалишвили В.Б. был научным руководителем проекта ИНТАС "Оценка сейсмического риска больших городов Грузии на основе современной концепции сейсмического микрорайонирования с учетом нелинейных свойств грунтов" (1999-2001); директором проекта ТАСИС "Оценка сейсмического риска портовых сооружений г. Поти" (2000); директором проекта Программы ЕВРАЗИЯ "Разработка методики страхования в сейсмостойком строительстве с учетом особенностей экономического развития Грузии" (1999-2002); содиректором от России проекта Программы НАТО "Наука за мир": Сейсмический риск больших городов Кавказа. Способы управления риском (2000-2005).

В.Б. Заалишвили - автор 480 опубликованных работ, в том числе 12 учебных пособий и научных монографий, 48 патентов. Под его руководством защищены одна докторская и 10 кандидатских диссертаций. Его ученики дважды в 2006 и 2007 гг. стали победителями в номинации "Лучший аспирант РАН" и "Кандидаты и доктора наук РАН". 

Область научных интересов В.Б. Заалишвили включает геофизику, в том числе инженерную сейсмологию, эндогенные и экзогенные процессы, инструментальный мониторинг опасных процессов, сейсмические опасность и риски и т.д.В 2010 - 2014 гг. на конкурсах XIII-XVI Московского международного Салона изобретений и инновационных технологий "АРХИМЕД" разработки, выполненные под руководством и участии Заалишвили В.Б. решением международного жюри удостоены шести золотых и одной серебряной медалями, а Заалишвили В.Б. награжден золотой медалью делегации Сербии "Никола Тесла", медалью лауреата выставки, орденом "Золотой Архимед" "за большой вклад в международное развитие науки и техники".

Заалишвили В.Б. - главный редактор журнала "Геология и геофизика Юга России", член редколлегии журналов "Вестник ВНЦ РАН", "Сейсмостойкое строительство. Безопасность сооружений", "Природные и техногенные риски. Безопасность сооружений", "Open Construction & Building Technology Journal", "The Open Occupational Health & Safety Journal".